Miranda Kerr sinh ra tại thành phố Sydney, nước Úc[5] và lớn lên tại một thị trấn nhỏ thuộc Gunnedah, New South Wales.[6]

Cha mẹ cô là bà Therese và ông John Kerr. Cô có một người em trai là Matthew, kém mình 2 tuổi. Trong một buổi phỏng vấn, cô tiết lộ tổ tiên mình phần lớn là người Anh di cư sang lục địa Úc, ngoài ra lai với người gốc Scotland và Pháp.[7] Hồi nhỏ cô "thường hay đua xe motor và cưỡi ngựa trong trang trại của bà ngoại". Cô kể rằng tuổi thơ của mình trải qua ở miền quê nước Úc "được tiếp thu một cách vững vàng...không một chút tự phụ, kiêu căng và không ai quan tâm bạn ăn mặc như thế nào. Và bạn được là chính bạn"[8][9]

Gia đình cô chuyển tới Brisbane để các con được trải nghiệm cuộc sống thành thị. Miranda tốt nghiệp trường nữ sinh công giáo All Hallows' School vào năm 2000. Sau đó cô theo học ngành dinh dưỡng và tâm lý học sức khỏe trước khi theo đuổi công việc người mẫu.[10][11]